Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "[\"von Wyl, Melissa\", \"K\\u00f6nemann, Sarah\", \"vom 
2
  "author": "[\"von Wyl, Melissa\", \"K\\u00f6nemann, Sarah\", \"vom 
            
3
Berg, Colette\"]",
3
Berg, Colette\"]",
            
4
  "author_email": null,
4
  "author_email": null,
            
5
  "creator_user_id": "064a4293-f097-4005-98d5-65b49b35ccf3",
5
  "creator_user_id": "064a4293-f097-4005-98d5-65b49b35ccf3",
            
6
  "extras": [
6
  "extras": [
            
7
    {
7
    {
            
8
      "key": "citation_publication",
8
      "key": "citation_publication",
            
9
      "value": "von Wyl, M., K\u00f6nemann, S., & vom Berg, C. (2023). 
9
      "value": "von Wyl, M., K\u00f6nemann, S., & vom Berg, C. (2023). 
            
10
Different developmental insecticide exposure windows trigger distinct 
10
Different developmental insecticide exposure windows trigger distinct 
            
11
locomotor phenotypes in the early life stages of zebrafish. 
11
locomotor phenotypes in the early life stages of zebrafish. 
            
12
Chemosphere, 317, 137874. 
12
Chemosphere, 317, 137874. 
            
13
https://doi.org/10.1016/j.chemosphere.2023.137874\n"
13
https://doi.org/10.1016/j.chemosphere.2023.137874\n"
            
14
    },
14
    },
            
15
    {
15
    {
            
16
      "key": "doi",
16
      "key": "doi",
            
17
      "value": "10.25678/000618"
17
      "value": "10.25678/000618"
            
18
    },
18
    },
            
19
    {
19
    {
            
20
      "key": "geographic_name",
20
      "key": "geographic_name",
            
21
      "value": "[]"
21
      "value": "[]"
            
22
    },
22
    },
            
23
    {
23
    {
            
24
      "key": "has_part",
24
      "key": "has_part",
            
25
      "value": "[]"
25
      "value": "[]"
            
26
    },
26
    },
            
27
    {
27
    {
            
28
      "key": "is_part_of",
28
      "key": "is_part_of",
            
29
      "value": "[]"
29
      "value": "[]"
            
30
    },
30
    },
            
31
    {
31
    {
            
32
      "key": "ispublication",
32
      "key": "ispublication",
            
33
      "value": "true"
33
      "value": "true"
            
34
    },
34
    },
            
35
    {
35
    {
            
36
      "key": "open_data",
36
      "key": "open_data",
            
37
      "value": "true"
37
      "value": "true"
            
38
    },
38
    },
            
39
    {
39
    {
            
40
      "key": "paper_doi",
40
      "key": "paper_doi",
            
41
      "value": "10.1016/j.chemosphere.2023.137874"
41
      "value": "10.1016/j.chemosphere.2023.137874"
            
42
    },
42
    },
            
43
    {
43
    {
            
44
      "key": "publicationlink",
44
      "key": "publicationlink",
            
45
      "value": "https://doi.org/10.1016/j.chemosphere.2023.137874"
45
      "value": "https://doi.org/10.1016/j.chemosphere.2023.137874"
            
46
    },
46
    },
            
47
    {
47
    {
            
48
      "key": "publicationlink_dora",
48
      "key": "publicationlink_dora",
            
49
      "value": 
49
      "value": 
            
50
"https://www.dora.lib4ri.ch/eawag/islandora/object/eawag:30029"
50
"https://www.dora.lib4ri.ch/eawag/islandora/object/eawag:30029"
            
51
    },
51
    },
            
52
    {
52
    {
            
53
      "key": "review_level",
53
      "key": "review_level",
            
54
      "value": "none"
54
      "value": "none"
            
55
    },
55
    },
            
56
    {
56
    {
            
57
      "key": "spatial",
57
      "key": "spatial",
            
58
      "value": "{}"
58
      "value": "{}"
            
59
    },
59
    },
            
60
    {
60
    {
            
61
      "key": "status",
61
      "key": "status",
            
62
      "value": "complete"
62
      "value": "complete"
            
63
    },
63
    },
            
64
    {
64
    {
            
65
      "key": "substances",
65
      "key": "substances",
            
66
      "value": "[\"Diazinon 
66
      "value": "[\"Diazinon 
            
67
6-15-18(19,16-7-2)17-11-8-10(5)13-12(14-11)9(3)4/h8-9H,6-7H2,1-5H3)\", 
67
6-15-18(19,16-7-2)17-11-8-10(5)13-12(14-11)9(3)4/h8-9H,6-7H2,1-5H3)\", 
            
68
\"Dimethoate 
68
\"Dimethoate 
            
69
nChI=1S/C5H12NO3PS2/c1-6-5(7)4-12-10(11,8-2)9-3/h4H2,1-3H3,(H,6,7))\", 
69
nChI=1S/C5H12NO3PS2/c1-6-5(7)4-12-10(11,8-2)9-3/h4H2,1-3H3,(H,6,7))\", 
            
70
\"Flonicamid 
70
\"Flonicamid 
            
71
3O/c10-9(11,12)7-1-3-14-5-6(7)8(16)15-4-2-13/h1,3,5H,4H2,(H,15,16))\", 
71
3O/c10-9(11,12)7-1-3-14-5-6(7)8(16)15-4-2-13/h1,3,5H,4H2,(H,15,16))\", 
            
72
\"Imidacloprid 
72
\"Imidacloprid 
            
73
-1-7(5-12-8)6-14-4-3-11-9(14)13-15(16)17/h1-2,5H,3-4,6H2,(H,11,13))\", 
73
-1-7(5-12-8)6-14-4-3-11-9(14)13-15(16)17/h1-2,5H,3-4,6H2,(H,11,13))\", 
            
74
\"Methomyl, 
74
\"Methomyl, 
            
75
(InChI=1S/C5H10N2O2S/c1-4(10-3)7-9-5(8)6-2/h1-3H3,(H,6,8)/b7-4+)\", 
75
(InChI=1S/C5H10N2O2S/c1-4(10-3)7-9-5(8)6-2/h1-3H3,(H,6,8)/b7-4+)\", 
            
76
\"Pirimicarb 
76
\"Pirimicarb 
            
77
=1S/C11H18N4O2/c1-7-8(2)12-10(14(3)4)13-9(7)17-11(16)15(5)6/h1-6H3)\", 
77
=1S/C11H18N4O2/c1-7-8(2)12-10(14(3)4)13-9(7)17-11(16)15(5)6/h1-6H3)\", 
            
78
\"Pymetrozine 
78
\"Pymetrozine 
            
79
5(10(16)14-13-8)12-6-9-3-2-4-11-5-9/h2-6H,7H2,1H3,(H,14,16)/b12-6+)\", 
79
5(10(16)14-13-8)12-6-9-3-2-4-11-5-9/h2-6H,7H2,1H3,(H,14,16)/b12-6+)\", 
            
80
\"Thiacloprid 
80
\"Thiacloprid 
            
81
lN4S/c11-9-2-1-8(5-13-9)6-15-3-4-16-10(15)14-7-12/h1-2,5H,3-4,6H2)\"]"
81
lN4S/c11-9-2-1-8(5-13-9)6-15-3-4-16-10(15)14-7-12/h1-2,5H,3-4,6H2)\"]"
            
82
    },
82
    },
            
83
    {
83
    {
            
84
      "key": "substances_generic",
84
      "key": "substances_generic",
            
85
      "value": "[\"insecticide\", \"organophosphate\", \"carbamate\", 
85
      "value": "[\"insecticide\", \"organophosphate\", \"carbamate\", 
            
86
\"neonicotinoid\", \"pyridin-based\"]"
86
\"neonicotinoid\", \"pyridin-based\"]"
            
87
    },
87
    },
            
88
    {
88
    {
            
89
      "key": "systems",
89
      "key": "systems",
            
90
      "value": "[\"laboratory\"]"
90
      "value": "[\"laboratory\"]"
            
91
    },
91
    },
            
92
    {
92
    {
            
93
      "key": "tags_string",
93
      "key": "tags_string",
            
94
      "value": "Spontaneous tail coiling,touch-evoked 
94
      "value": "Spontaneous tail coiling,touch-evoked 
            
95
response,locomotion,recovery,critical 
95
response,locomotion,recovery,critical 
            
96
window,insecticides,developmental neurotoxicity"
96
window,insecticides,developmental neurotoxicity"
            
97
    },
97
    },
            
98
    {
98
    {
            
99
      "key": "taxa",
99
      "key": "taxa",
            
100
      "value": "[\"Danio rerio\"]"
100
      "value": "[\"Danio rerio\"]"
            
101
    },
101
    },
            
102
    {
102
    {
            
103
      "key": "taxa_generic",
103
      "key": "taxa_generic",
            
104
      "value": "[\"fish\"]"
104
      "value": "[\"fish\"]"
            
105
    },
105
    },
            
106
    {
106
    {
            
107
      "key": "timerange",
107
      "key": "timerange",
            
108
      "value": "[\"[2020 TO 2021]\"]"
108
      "value": "[\"[2020 TO 2021]\"]"
            
109
    },
109
    },
            
110
    {
110
    {
            
111
      "key": "variables",
111
      "key": "variables",
            
112
      "value": "[\"none\"]"
112
      "value": "[\"none\"]"
            
113
    }
113
    }
            
114
  ],
114
  ],
            
115
  "groups": [],
115
  "groups": [],
            
116
  "id": "d1fb0615-63e2-4fe8-9657-6021f3395272",
116
  "id": "d1fb0615-63e2-4fe8-9657-6021f3395272",
            
117
  "isopen": false,
117
  "isopen": false,
            
118
  "license_id": null,
118
  "license_id": null,
            
119
  "license_title": null,
119
  "license_title": null,
            
120
  "maintainer": "Koenemann, Sarah",
120
  "maintainer": "Koenemann, Sarah",
            
121
  "maintainer_email": "vom Berg, Colette <Colette.vomBerg@eawag.ch>",
121
  "maintainer_email": "vom Berg, Colette <Colette.vomBerg@eawag.ch>",
            
122
  "metadata_created": "2023-04-06T08:51:39.152608",
122
  "metadata_created": "2023-04-06T08:51:39.152608",
            
123
  "metadata_modified": "2023-04-06T08:51:39.152618",
123
  "metadata_modified": "2023-04-06T08:51:39.152618",
            
124
  "name": 
124
  "name": 
            
125
-exposure-windows-trigger-distinct-locomotor-phenotypes-in-zebrafish",
125
-exposure-windows-trigger-distinct-locomotor-phenotypes-in-zebrafish",
            
126
  "notes": "Due to their extensive use and high biological activity, 
126
  "notes": "Due to their extensive use and high biological activity, 
            
127
insecticides largely contribute to loss of biodiversity as well as 
127
insecticides largely contribute to loss of biodiversity as well as 
            
128
environmental pollution. The regulation of insecticides mainly relies 
128
environmental pollution. The regulation of insecticides mainly relies 
            
129
on lethal concentrations, however, also sub-lethal effects such as 
129
on lethal concentrations, however, also sub-lethal effects such as 
            
130
alterations in behavior and neurodevelopment can significantly affect 
130
alterations in behavior and neurodevelopment can significantly affect 
            
131
fitness of the individual and population dynamics and therefore need 
131
fitness of the individual and population dynamics and therefore need 
            
132
consideration. Moreover, it is important to understand the impact of 
132
consideration. Moreover, it is important to understand the impact of 
            
133
exposure timing during development, which currently lacks relevant 
133
exposure timing during development, which currently lacks relevant 
            
134
knowledge. Here, we investigated whether there are periods during 
134
knowledge. Here, we investigated whether there are periods during 
            
135
neurodevelopment of fish, which are particularly vulnerable to 
135
neurodevelopment of fish, which are particularly vulnerable to 
            
136
insecticide exposure. Therefore, we exposed zebrafish embryos to six 
136
insecticide exposure. Therefore, we exposed zebrafish embryos to six 
            
137
different insecticides with a cholinergic mode of action for 24 hours 
137
different insecticides with a cholinergic mode of action for 24 hours 
            
138
during different periods of neurodevelopment and measured locomotor 
138
during different periods of neurodevelopment and measured locomotor 
            
139
output using an age-matched behavior assay. We used the 
139
output using an age-matched behavior assay. We used the 
            
140
organophosphates diazinon and dimethoate, the carbamates pirimicarb 
140
organophosphates diazinon and dimethoate, the carbamates pirimicarb 
            
141
and methomyl as well as the neonicotinoids thiacloprid and 
141
and methomyl as well as the neonicotinoids thiacloprid and 
            
142
imidacloprid because they are abundant in the environment and 
142
imidacloprid because they are abundant in the environment and 
            
143
cholinergic signaling plays a major role during key processes of 
143
cholinergic signaling plays a major role during key processes of 
            
144
neurodevelopment. We found that early embryonic motor behaviors, as 
144
neurodevelopment. We found that early embryonic motor behaviors, as 
            
145
measured by spontaneous tail coiling, increased upon exposure to most 
145
measured by spontaneous tail coiling, increased upon exposure to most 
            
146
insecticides, while later movements, measured through touch-evoked 
146
insecticides, while later movements, measured through touch-evoked 
            
147
response and light-dark transition assay, rather decreased for the 
147
response and light-dark transition assay, rather decreased for the 
            
148
same insecticides and exposure duration. Moreover, the observed 
148
same insecticides and exposure duration. Moreover, the observed 
            
149
effects were more pronounced when the exposure windows were temporally 
149
effects were more pronounced when the exposure windows were temporally 
            
150
closer to the performing of the respective behavioral assay. However, 
150
closer to the performing of the respective behavioral assay. However, 
            
151
the measured effects recovered after a short period, indicating that 
151
the measured effects recovered after a short period, indicating that 
            
152
none of the exposure windows chosen here are particularly critical, 
152
none of the exposure windows chosen here are particularly critical, 
            
153
but rather that insecticides acutely interfere with neuronal function 
153
but rather that insecticides acutely interfere with neuronal function 
            
154
at all stages as long as they are present. Overall, our results 
154
at all stages as long as they are present. Overall, our results 
            
155
contribute to a better understanding of the risks posed by cholinergic 
155
contribute to a better understanding of the risks posed by cholinergic 
            
156
insecticides to fish and provide an important basis for the 
156
insecticides to fish and provide an important basis for the 
            
157
development of safe regulations to improve environmental health.",
157
development of safe regulations to improve environmental health.",
            
n
158
  "num_resources": 0,
n
158
  "num_resources": 1,
            
159
  "num_tags": 7,
159
  "num_tags": 7,
            
160
  "organization": {
160
  "organization": {
            
161
    "approval_status": "approved",
161
    "approval_status": "approved",
            
162
    "created": "2019-09-18T14:11:47.883914",
162
    "created": "2019-09-18T14:11:47.883914",
            
163
    "description": "We are investigating the effects of environmental 
163
    "description": "We are investigating the effects of environmental 
            
164
threats on the organism with the aim to mechanistically dissect 
164
threats on the organism with the aim to mechanistically dissect 
            
165
toxicological and adaptive responses on the molecular level. The 
165
toxicological and adaptive responses on the molecular level. The 
            
166
nervous system extracts and integrates information from the 
166
nervous system extracts and integrates information from the 
            
167
environment, and controls physiology and behavior. By analyzing 
167
environment, and controls physiology and behavior. By analyzing 
            
168
environmentally-driven behavioral phenotypes in larval and adult 
168
environmentally-driven behavioral phenotypes in larval and adult 
            
169
zebrafish, different parts of their nervous system can be assessed, 
169
zebrafish, different parts of their nervous system can be assessed, 
            
170
which allows us to gain insight into the mechanism of how such 
170
which allows us to gain insight into the mechanism of how such 
            
171
threatening substances act and what effects they exert on the body. 
171
threatening substances act and what effects they exert on the body. 
            
172
Further analysis of the structure and function of the nervous system 
172
Further analysis of the structure and function of the nervous system 
            
173
using state-of-the-art imaging techniques and optogenetic tools help 
173
using state-of-the-art imaging techniques and optogenetic tools help 
            
174
us to gain a detailed understanding of the phenotypes emerging upon 
174
us to gain a detailed understanding of the phenotypes emerging upon 
            
175
exposure to the threat. In addition to the phenotypic consequences, we 
175
exposure to the threat. In addition to the phenotypic consequences, we 
            
176
want to understand  the underlying molecular basis. Therefore, 
176
want to understand  the underlying molecular basis. Therefore, 
            
177
candidate genes are selected based on current knowledge derived from 
177
candidate genes are selected based on current knowledge derived from 
            
178
OMICs data and computational modeling, and are studied using genome 
178
OMICs data and computational modeling, and are studied using genome 
            
179
editing tools (CRISPR/Cas9) and gene expression analysis. Moreover,  
179
editing tools (CRISPR/Cas9) and gene expression analysis. Moreover,  
            
180
transcriptome and proteome profiling techniques are employed to 
180
transcriptome and proteome profiling techniques are employed to 
            
181
further gain unbiased insight into the molecular mechanisms of action 
181
further gain unbiased insight into the molecular mechanisms of action 
            
182
of a given substance.",
182
of a given substance.",
            
183
    "id": "4e02d0a6-f2ff-474c-a67d-d78f1317ee2c",
183
    "id": "4e02d0a6-f2ff-474c-a67d-d78f1317ee2c",
            
184
    "image_url": 
184
    "image_url": 
            
185
ileadmin/Domain1/Abteilungen/utox/Molecular_Toxicology/molec_tox.jpg",
185
ileadmin/Domain1/Abteilungen/utox/Molecular_Toxicology/molec_tox.jpg",
            
186
    "is_organization": true,
186
    "is_organization": true,
            
187
    "name": "molecular-toxicology",
187
    "name": "molecular-toxicology",
            
188
    "state": "active",
188
    "state": "active",
            
189
    "title": "Molecular Toxicology",
189
    "title": "Molecular Toxicology",
            
190
    "type": "organization"
190
    "type": "organization"
            
191
  },
191
  },
            
192
  "owner_org": "4e02d0a6-f2ff-474c-a67d-d78f1317ee2c",
192
  "owner_org": "4e02d0a6-f2ff-474c-a67d-d78f1317ee2c",
            
193
  "private": false,
193
  "private": false,
            
194
  "relationships_as_object": [],
194
  "relationships_as_object": [],
            
195
  "relationships_as_subject": [],
195
  "relationships_as_subject": [],
            
t
196
  "resources": [],
t
196
  "resources": [
            
197
    {
            
198
      "allowed_users": "[]",
            
199
      "cache_last_updated": null,
            
200
      "cache_url": null,
            
201
      "citation": "",
            
202
      "created": "2023-04-06T08:51:39.887575",
            
203
      "description": "",
            
204
      "format": "TXT",
            
205
      "hash": 
            
206
"6950328c44b4720373bf41e9f730d221d736dedb4c54c5cd8aff113bb76b7d3a",
            
207
      "hashtype": "sha256",
            
208
      "id": "d5794841-0d67-4db6-86fe-4d7e10887b4b",
            
209
      "last_modified": "2023-04-06T08:51:39.826445",
            
210
      "mimetype": "text/plain",
            
211
      "mimetype_inner": null,
            
212
      "name": "Readme.txt",
            
213
      "package_id": "d1fb0615-63e2-4fe8-9657-6021f3395272",
            
214
      "position": 0,
            
215
      "resource_type": "Dataset",
            
216
      "restricted_level": "public",
            
217
      "size": 1867,
            
218
      "state": "active",
            
219
      "url": 
            
220
72/resource/d5794841-0d67-4db6-86fe-4d7e10887b4b/download/readme.txt",
            
221
      "url_type": "upload"
            
222
    }
            
223
  ],
            
197
  "state": "active",
224
  "state": "active",
            
198
  "tags": [
225
  "tags": [
            
199
    {
226
    {
            
200
      "display_name": "Spontaneous tail coiling",
227
      "display_name": "Spontaneous tail coiling",
            
201
      "id": "6bc0cebe-447a-439d-8a55-04f4fa72ec18",
228
      "id": "6bc0cebe-447a-439d-8a55-04f4fa72ec18",
            
202
      "name": "Spontaneous tail coiling",
229
      "name": "Spontaneous tail coiling",
            
203
      "state": "active",
230
      "state": "active",
            
204
      "vocabulary_id": null
231
      "vocabulary_id": null
            
205
    },
232
    },
            
206
    {
233
    {
            
207
      "display_name": "critical window",
234
      "display_name": "critical window",
            
208
      "id": "8bfc5623-9174-4162-9292-76a1429814ed",
235
      "id": "8bfc5623-9174-4162-9292-76a1429814ed",
            
209
      "name": "critical window",
236
      "name": "critical window",
            
210
      "state": "active",
237
      "state": "active",
            
211
      "vocabulary_id": null
238
      "vocabulary_id": null
            
212
    },
239
    },
            
213
    {
240
    {
            
214
      "display_name": "developmental neurotoxicity",
241
      "display_name": "developmental neurotoxicity",
            
215
      "id": "d65be3b9-018a-4726-8f49-78f9411d3538",
242
      "id": "d65be3b9-018a-4726-8f49-78f9411d3538",
            
216
      "name": "developmental neurotoxicity",
243
      "name": "developmental neurotoxicity",
            
217
      "state": "active",
244
      "state": "active",
            
218
      "vocabulary_id": null
245
      "vocabulary_id": null
            
219
    },
246
    },
            
220
    {
247
    {
            
221
      "display_name": "insecticides",
248
      "display_name": "insecticides",
            
222
      "id": "8d228132-eb95-4dd7-84ff-52980a48de3f",
249
      "id": "8d228132-eb95-4dd7-84ff-52980a48de3f",
            
223
      "name": "insecticides",
250
      "name": "insecticides",
            
224
      "state": "active",
251
      "state": "active",
            
225
      "vocabulary_id": null
252
      "vocabulary_id": null
            
226
    },
253
    },
            
227
    {
254
    {
            
228
      "display_name": "locomotion",
255
      "display_name": "locomotion",
            
229
      "id": "4c631885-a5b7-4727-b7f4-5bbc7559b45a",
256
      "id": "4c631885-a5b7-4727-b7f4-5bbc7559b45a",
            
230
      "name": "locomotion",
257
      "name": "locomotion",
            
231
      "state": "active",
258
      "state": "active",
            
232
      "vocabulary_id": null
259
      "vocabulary_id": null
            
233
    },
260
    },
            
234
    {
261
    {
            
235
      "display_name": "recovery",
262
      "display_name": "recovery",
            
236
      "id": "0d4dd526-3feb-4ed4-817e-8d19400b08b0",
263
      "id": "0d4dd526-3feb-4ed4-817e-8d19400b08b0",
            
237
      "name": "recovery",
264
      "name": "recovery",
            
238
      "state": "active",
265
      "state": "active",
            
239
      "vocabulary_id": null
266
      "vocabulary_id": null
            
240
    },
267
    },
            
241
    {
268
    {
            
242
      "display_name": "touch-evoked response",
269
      "display_name": "touch-evoked response",
            
243
      "id": "2696cd4b-d1c2-4e43-9fde-e4d0edced4e1",
270
      "id": "2696cd4b-d1c2-4e43-9fde-e4d0edced4e1",
            
244
      "name": "touch-evoked response",
271
      "name": "touch-evoked response",
            
245
      "state": "active",
272
      "state": "active",
            
246
      "vocabulary_id": null
273
      "vocabulary_id": null
            
247
    }
274
    }
            
248
  ],
275
  ],
            
249
  "title": "Data for: Different developmental insecticide exposure 
276
  "title": "Data for: Different developmental insecticide exposure 
            
250
windows trigger distinct locomotor phenotypes in the early life stages 
277
windows trigger distinct locomotor phenotypes in the early life stages 
            
251
of zebrafish",
278
of zebrafish",
            
252
  "type": "dataset",
279
  "type": "dataset",
            
253
  "url": "https://doi.org/10.25678/000618/",
280
  "url": "https://doi.org/10.25678/000618/",
            
254
  "version": null
281
  "version": null
            
255
}
282
}